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臨床檢測中ctDNA的意義,德國MB核酸污染祛除助力科研

更新時間:2023-08-03  |  點擊率:1125

隨著核酸檢測技術的發展,疾病檢測技術也得以發展。核酸實驗中即使只有一個污染的DNA分子被檢測到,也會使整個PCR檢測過程出現誤差。為確保PCR試驗數據準確,預防DNARNA交叉污染,PCR實驗室大多會常備DNA/RNA污染清除劑。PCR Clean可有效地降解大多數表面上(輕質金屬或有色金屬除外)的擴增子,質粒或基因組DNARNA。該產品還能有效地去除DNA酶和RNA酶。

 

在過去的20年里,癌癥存活率一直在不斷提高,這在很大程度上歸功于更有效的治療和改進的患者管理策略。細化識別患者誰可能受益于輔助治療后明確的管理是優化患者護理的關鍵。由于適當的干預可以改善預后,明智地使用額外的治療可以使復發風險低的患者免受不良治療效果和不必要的費用。

 

目前的疾病管理模式以腫瘤特異性、分期為基礎的建議為中心,主要依靠病理和影像學結果來優化患者的治療計劃。雖然影像學是監測疾病進展或復發以及衡量治療反應的標準方法,但放射學結果有時難以正確解釋,導致假陽性和陰性的高發生率。基于血液的代謝腫瘤標志物(如癌胚抗原(CEA)、癌抗原(CA)-125CA19-9和乳酸脫氫酶(LDH))是評估疾病狀態的一種非侵入性方法。然而,許多這些已建立的生物標志物被認為是不可靠的,因為它們可能由于與癌癥無關的疾病而升高,導致低靈敏度和特異性。

 

ctDNA已經成為一種非侵入性的、基于血液的生物標志物,廣泛反映了腫瘤組織中發現的體細胞變異。已經開發了幾種測量ctDNA的方法,例如基于小組的測定,下一代測序和液滴數字聚合酶鏈反應,并在其他地方進行了深入討論。除了每種腫瘤類型固有的生物學差異之外,每種檢測的潛在ctDNA檢測方法和分析驗證措施(如敏感性和特異性)的差異也會影響對結果的后續解釋。無論采用何種檢測方法,在臨床解釋ctDNA結果時,也應考慮通過變異等位基因分數(作為百分比)或腫瘤分數(作為每毫升腫瘤分子的平均數量)來定量測量循環腫瘤負荷。ctDNA有多種應用,包括早期癌癥檢測、用于治療選擇的綜合基因組分析、分子殘留病(MRD)檢測、復發監測和治療反應監測。這些臨床應用的適當測定可能會有所不同,這取決于在特定的臨床場景中必須評估什么。

 

臨床研究已經證實ctDNA檢測及其濃度與腫瘤負荷、治療反應和預后之間存在關聯。使用不同分析技術的大量研究表明,ctDNA是一種敏感和特異性的MRD檢測生物標志物。它可能比放射成像和其他標準護理(SOC)方法早幾個月,但最好與標準監測診斷結合使用。然而,目前對ctDNA臨床應用的了解僅限于主要是觀察性或軼事性質的研究,并且僅限于特定適應癥。有必要檢查基于ctdnaMRD檢測在跨適應癥的介入性試驗中的臨床應用。目前這類臨床試驗的研究結果已經在之前的文獻中進行了回顧。最后,目前只有少數基于ctdnaMRD檢測方法可供臨床醫生商業化使用,每種方法都具有不同程度的預測和預后價值。因此,盡管ctDNA在癌癥患者中的應用的現有數據很有希望,但至關重要的是,訂購提供者了解這種新型生物標志物的含義、優勢和局限性,以便將結果最佳地應用于臨床實踐。

 

研究人員對ctDNA進行優化,用于實體腫瘤MRD檢測。研究人員還強調了ctDNA如何幫助指導癌癥患者在其疾病過程中的臨床管理。

 

相關研究發表在《Nature》上,文章標題為:“Practical recommendations for using ctDNA in clinical decision making"。

 

ctDNA檢測在血液學惡性腫瘤中的應用和效用先前已經討論過。早期癌癥檢測的篩查方法也會檢查游離DNA (cfDNA),盡管也會分析其他特征(例如甲基化)。初步數據表明這種篩檢的臨床效用,但它們不是用于監測疾病進展的,因此不包括在本討論中。本篇研究中,研究人員首先討論在手術或最終治療之前和之后ctDNA結果的解釋。然后研究人員討論了當ctDNA檢測用于MRD時的技術考慮。科研人員對完成SOC治療后ctdna陽性和陰性患者的處理提出建議。最后,本篇文章討論了ctDNA檢測在新輔助治療中治療反應監測的應用,特別是在免疫治療的背景下。在所有情況下,評估ctDNA的結果都應該在對患者進行更大范圍的綜合評估的背景下進行,從而完善標準的臨床分期和風險分層。


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